影片承接第一集母亲维尼卡怀上赛斯孩子的伏笔，当她产下一枚蝇蛹时被就地吓死。政府的科研机关巴托产业园收养了苍蝇之子马丁·布朗多，由巴托产业的老总巴托师长扶养。巴托师长亲近监视着马丁的一举一动，表面上把马丁视如己出，实则却把…