故事的地址产生在这个整年都会难以想象地开着樱花而出名的新月型岛--初音岛。梦幻的初音岛上产生了难以想象的现象，本不会枯萎的樱花在一夜之间突然枯萎了。两年以后，樱花再度在初音岛上绽放。主人公朝仓纯一进入风见学园，继续过着校园…