全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，以后过了数千年——。拥有超越人类的脑筋，生成的科学少年·千空苏醒了。“从石器期间到现代文化，要跨越这科学史上的200万年！”。在这走投无路的状况中，千空寻觅着伙伴，决心取回原先的世界！