在实现世界性非武装化的2007年，如超现代文明人幽怜所预言:二大怪兽“哥尔赞”及“美尔巴”出现了。在怪兽攻击的目标——金字塔内，发明了三座巨大的石像。此中两座巨像被怪兽摧毁了。在这生死关头，有着超现代人遗传因子，属于地球和平…

在邪神加坦杰厄和迪迦奥特曼的决战结束后，人类世界迎来了长达两年的和平岁月。这一日，入间队长随同GUTS考古队来到位于南承平洋的远古遗迹露露耶，他们再次发明了业已毁灭的超现代城市以及三尊邪神的石像希特拉（婆裟羅天明 饰）、达拉…

大悟与麗奈的兒子翼在一次飛機測試的途中回到了现代，并被一幫村民救起。企圖安排黑暗的杜古馬、大達拿和我龍操縱怪獸佐蒙多展開襲擊村子的計劃。翼和村民準備對抗怪獸的入侵……一面倒防守的村民的身邊出現了一名旅途中的勇士馬巴，他手…