一所位于东京都千代田区的古代高校“音乃木坂学院”，由于入读的学生人数骤减，所以正面临着废校的危急。此中有三名少女想到一条妙计——成为偶像，只有她们成为偶像，学校的名望便会增加，而入读学生的人数亦会上升。就这样，九位个性鲜…

故事产生在位于东京都的音乃木坂学院中，经济不景气，生齿老龄化等等的社会问题让这所学校的招生成为了难题。找不到学生，学校只能关门大吉，就在这时，九名少女站了出来。这些对学校感情极深的少女们决议，要为了珍爱学校不被废校而做出…

故事描绘了20XX年，突如其来的“通往异世界的门”在东京银座出现，从中涌出来了大批怪物和戎行。而陆上自卫队在击退它们的同时，还赶赴了门另一边的“特区”。因而，担任了第叁伺探队指挥的二等陆卫的宅男伊丹耀司，与帮助被巨大炎龙袭击…