简介：城都联盟篇结束后，小霞为了接替出门旅行的三位姐姐而不能不返回华蓝市担任道馆训练家，小刚也由于因家里有事和小智分手了。小智重新动身，基于想要以一个新人的心态继续进修的心态，所以只带着皮卡丘只身前去丰缘地域，在那里认识了新人训练家小遥和其弟弟小胜，后来小刚又重新进入，因而四人并展开斩新的冒险。 超世代共分为丰缘联盟及对战开拓区两篇，和第一部的差别之处是，故事项成了两条主线：一方面小智为了加入丰缘联盟，尽力挑战道馆而收集徽章。联盟大会结束后，则改挑战故乡关都地域的对战开拓区；另一方面小遥则以成为顶级调和训练家为目标，挑战各地的富丽大赛取得缎带，加入富丽大型庆典。两人都为了达成各自的目标，与神奇瑰宝一同斗争。
