故事以大都市纽特市为舞台，在那里正在兴修为珍爱神奇瑰宝而设立的设施神奇瑰宝山庄，行将在近期落成。可是因落空了过去的故乡，而将所见的一切都视作敌人攻击的盖诺赛克特也出现在这里！只见他朝着在现场的小智和皮卡丘发射破坏技术，危…

位于卡洛斯地域有一座协调安好的地下王国——钻石王国。调皮心爱的精灵公主蒂安希（松本真理香 配音）备受宠爱，然而她似乎并未拥有让维持着王国运行的神圣钻石继续发生能量的能力，为此她在长老的指点下出发前往寻找传说中的精灵哲尔尼…

正在进行求学之旅的小智（松本梨香 配音）、小刚（うえだゆうじ 配音）、小遥（KAORI 配音）和小正（山田ふしぎ 配音），在前去下一个城镇的路上迷失方向。口渴难耐的他们在荒原中偶遇巡回表演的艳丽少女洋美（眞鍋かをり 配音）及其地点…

在每年一部的《神奇瑰宝》戏院版面前也难以匹敌（战绩请看：日本动画影戏历代票房收入排行榜 2007日本戏院版动画票房十强出炉），作为系列的第13弹作品，《神奇瑰宝》戏院版《幻影的霸者索罗亚克》于2010年7月10日起在全日本东宝系新片隆…

小智一行人在大树下打盹时，顽皮的波克比却没有和大伙一路入睡而跑进来玩耍，为了寻觅走失的波克比，皮卡丘和所有的宝可梦们一路来到一个庞大的树林丛中，在里面遇见了电击怪，还认识了一大堆的新朋友，就在朋友们玩得很康乐的时辰，突如…

和动物学家马丁·休斯盖姆斯一路加入抢救稀有兽宝宝的行动吧。它们是大自然的神奇瑰宝，这个行动是珍爱地球上最脆弱物种的环节办法。在每一集节目中，他搜寻稀有动物的足迹及相关传说，对神秘动物例如狞獾、欧洲秃鹫和马达加斯加狐猴等生…