并称为“全国霸道三剑”的生成牙、丛云牙和铁碎牙分担天、地、人三界，当年全数为犬夜叉的父亲斗牙王所拥有。斗牙王与人类公主十六夜相恋，生下犬夜叉，此举惹来暗恋十六夜的武将霎时猛丸的嫉妒。身负重伤的斗牙王用生成牙救活被猛丸杀死…

邪恶的奈落与犬夜叉一行的战争愈演愈烈，为了珍爱心脏不受危险，他在白灵山分手出一个能洞察人类心灵的婴儿，并将心脏托其保管。在此以后，婴儿被某高僧砍作两半，酿成白童子和赤子。当得知奈落心脏的重要性时，这两个一样邪恶的童子决议…

正在读初中三年级的女生——日暮戈薇是一位家住在神社的普通女孩子。15岁生日那天，被魔鬼──百足妖妇拖入神社的枯井中，来到了500年前的日本战国时代，并与已被封印的半妖——犬夜叉相遇。犬夜叉自称是为得到四魂之玉以成为真实的魔鬼…